系统生物信息学–工程案例法（翻译版）

本书为Systems Bioinformatics: An Engineering Case-Based Approach翻译版，原书作者为Gil Alterovitz 和MarcoF. Ramoni。系统生物信息学为系统生物学和生物信息学的交叉提供了一种量化的、基于案例的方法。
全书共分为六个部分，主要包括数字信号处理（第二部分）、控制系统（第三部分）、通信（第四部分）、合成生物学（第五部分）以及反向工程（第六部分），结合信号处理、电路分析、控制系统和通信工程中的强大计算工具，介绍了生物信息学研究中的定量的、系统的方法，形象地展示了工程背景下的生物学过程，有助于读者更容易地使用专业技能解决系统生物信息领域的挑战。

前辅文
一部分 引言：分子与细胞生物学
1章 分子和细胞生物学——工程的观点
1.1 细胞的结构与功能
1.2 细胞信息处理引论
1.3 蛋白质的重要性和多样性
1.4 DNA复制：复制编码
1.5 转录：发送一个信使
1.6 翻译：合成蛋白质
1.7 基因表达调控
1.8 基因工程
1.9 小结
致谢
参考文献
2章 蛋白质组学：从基因组到蛋白质组
2.1 定义蛋白质组
2.1.1 从基因到蛋白质
2.1.2 什么是蛋白质组学？
2.1.3 功能蛋白质组学
2.2 功能蛋白质组学方法中基因集合的构建
2.2.1 克隆工程的靶基因选择
2.2.2 克隆生产
2.2.3 测序和分析
2.2.4 复制品维护和分配
2.3 克隆在功能蛋白质组学方法中的应用
2.3.1 高通量蛋白质生产
2.3.2 蛋白质矩阵
2.3.3 基于细胞的功能蛋白质组学实验
参考文献
二部分 分析：信号处理
3章 细胞级生物信号处理
3.1 基本信号处理概念
3.1.1 信号
3.1.2 系统
3.1.3 随机过程和频谱分析
3.2 信号检测和估计
3.2.1 DNA测序
3.2.2 基因识别
3.2.3 蛋白质热点识别
3.3 系统识别和分析
3.3.1 基因调节系统
3.3.2 蛋白质信号系统
3.4 小结
致谢
参考文献
4章 质谱分析中的信号处理方法
4.1 引言
4.1.1 数据采集法
4.1.2 电离技术的起源
4.1.3 样品处理
4.1.4 离子化
4.1.5 通过质量电荷分离离子
4.1.6 离子检测和数据记录
4.1.7 数据预处理
4.1.8 样本数据
4.2 信号重采样
4.2.1 算法说明与讨论
4.2.2 下采样实例
4.3 背景校正
4.3.1 算法说明与讨论
4.3.2 基线减法实例
4.4 校准质荷比
4.4.1 算法说明与讨论
4.4.2 校正质荷比值的案例分析
4.5 相对强度标准化
4.6 平滑噪声
4.6.1 线性拟合滤波平滑
4.6.2 Savitzky和Golay滤波器平滑
4.6.3 噪声平滑实例
4.7 识别离子峰
参考文献
三部分 分析：控制与系统
5章 控制与系统基本原理